2일에서 4일정도로 매우짧음

구제역 바이러스에 감염된 소에서는 체온상승, 식욕부진, 침울, 우유 생산량의 급격한 감소 등이 나타난다.
발병 후 24시간 이내에 침을 심하게 흘리고, 혀와 잇몸 등에 물집이 생긴 것을 관찰할 수 있으며, 입맛 다시는 소리는 내기도 한다.
물집은 발굽의 사이와 제관부, 젖꼭지 등에서도 관찰된다.
물집은 곧 터져서 피부가 드러나고 짓무르고 헐게 된다.
구제역 바이러스에 감염된 6개월 미만의 송아지는 심근염에 의해 죽는 경우가 있으며, 이 경우 심근에 나타나는 특징적인 병변을 호반심이라고 한다.
일반적으로 이환율은 높고 폐사율은 낮은 편이나 어린 송아지의 경우 성우에 비하여 폐사율이 높으며 임신우에서는 유산을 초래하기도 한다.
감염된 소들은 1주 이상 거의 먹지 못하며, 절뚝거리며 유방염, 산유량 격감 등의 경제적 피해가 발생한다.
특히 젖소에서는 착유량이 50% 정도 감소한다.

구제역 바이러스에 감염된 돼지에서 특징적으로 관찰되는 증상은 절뚝러미이다.
발굽의 심한 병변과 고통으로 인해 제대로 서거나 걷지 못하고 절뚝거리거나 무릎으로 기어 다닌다.
발굽의 물집이 터져 피부가 벗겨진 자리에 세균에 의한 2차 감염이 일어나고 이로 인해 발톱이 탈락되기도 한다.
입 주변의 물집형승은 소의 경우처럼 전형적이지는 않으나, 콧잔등에는 큰 물집이 형성되며 쉽게 터지는 경우가 많다.